В НАО «КазНМУ им.С.Д. Асфендиярова» координацию научно- исследовательской деятельности осуществляет Департамент науки. Новая структура НАО «КазНМУ им. С.Д. Асфендиярова» утверждена решением Правления №5 от 3 августа 2023 года.
Департамент науки является самостоятельным структурным подразделением Университета. Департамент науки находится в прямом подчинении проректора по науке Университета.
В целях повышения эффективности научных исследований и сокращения сроков создания и внедрения научно-исследовательской работы, а также для решения актуальных и практически значимых для обеспечения научной деятельности задач подструктурами Департамента науки являются:
— Отдел науки и публикационной активности (ОНиПА);
— Отдел по управлению научными проектами и программами (ОУНПиП);
— Центр коммерциализации технологий (ЦКТ).

Целью Отдела науки и публикационной активности (ОНиПА) является стимулирование публикационной активности и академической честности.

Целью Отдела по управлению научными проектами и программами (ОУНПиП) является координация, анализ и поддержка в проведении научно-исследовательской работы профессорско-преподавательского состава (ППС) университета.

Целью Центра коммерциализации технологий (ЦКТ) является содействие ученым в реализации инновационных научных проектов по медицинским направлениям.

Департамент науки в процессе осуществления своей деятельности взаимодействует со следующими структурными подразделениями:

− Департамент экономики и планирования: Планирование и согласование заявки на приобретение товаров и услуг на соответствующий финансовый год. Предоставление информации о технической спецификации, коммерческого и ценового предложения в Управление госзакупок; Содействие и оказание финансового сопровождения по формированию комплексной документации по планируемым и выполняемым научно-техническим проектам (далее — НТП) программно-целевого и грантового финансирования или НТП, финансируемых другими источниками (формирование бюджетной заявки, составление сметы расходов и исполнение по ним). Проверка и согласование актов выполненных работ по НТП. Предоставление информации о наличии, состоянии (износе) и движении основных средств, инвентаризация, списание, внутреннее перемещение, прием-передача при смене мат-отв. лица;
− Юридическое управление: Разработка, согласование, утверждение проекта договора (с юридическими лицами). Юридическая консультация по телефону.
− Департамент стратегического мониторинга и международного сотрудничества:
Планирование и согласование «Стратегических показателей на 2019-2023 годы НАО КазНМУ им. С.Д. Асфендиярова», План развития школ/факультетов на 2021-2022-2023 гг. Информация, необходимые для мониторинга реализации стратегического развития Университета, отчеты по реализации стратегических показателей департамента науки. Консультация с сотрудниками подразделения по телефону. Оказание содействия по приглашению зарубежного профессора для повышения квалификации ППС и научных сотрудников по вопросам научно-исследовательской деятельности. Оказание содействия в координации международных, республиканских, региональных, отраслевых научных конгрессов, съездов, конференций, симпозиумов, школ, семинаров по актуальным вопросам современной медицины.
− Департамент цифровизации: Обеспечение рабочих мест для сотрудников
департамента современными компьютерами, связанными с единой системой управления Университетом и электронными обучающими комплексами. Консультирование по приобретению и использованию программных средств для выполнения задач департамента. Сопровождение и развитие информационных систем (автоматизированной информационной системы «Салем офис») Университета, с выходом в глобальную сеть INTERNET и другие корпоративные, региональные и отраслевые сети, включая общеуниверситетские и локальные компьютерные сети. Установка программ и ремонт принтеров.
− Департамент развития человеческих ресурсов: Обеспечение отбора кадров в департамент. Организация работы по поощрению сотрудников департамента. Обеспечение участия сотрудников департамента по аттестации и оценке научно-исследовательской деятельности сотрудников Университета. Обеспечение повышение квалификации сотрудников департамента. Согласование табеля учета рабочего времени ежемесячно, представлений претендентов на награждения. Согласование Положения о департаменте, должностной инструкции сотрудников. Консультация по кадровым вопросам.
− Департамент эксплуатационных работ: Обеспечение бесперебойного теплоснабжения, ремонта корпусов, кабинетов департамента. Оказание услуг по типографии: печатание всех видов (черно-белом, цветном) и форм А3, А4 программ конференции, семинаров и т.д.
− Ученый совет: Принятие решении и утверждение финансирования НТП и иных вопросов по научной деятельности.
− Школы (ответственные по НИР и НИРС кафедр): Согласование и утверждение годовых планов и отчетов по научно-исследовательской деятельности кафедр, сбор информации по индикаторам ранжирования организаций медицинского образования и науки по результатам научной и инновационной деятельности, реализация научно-исследовательских проектов и программ, проведение консультации по научным вопросам.
− Управление рисков и внутреннего контроля: Соблюдение требований системы менеджмента качества, системы менеджмента противодействия коррупции, получение консультации по подготовке к внешнему и внутреннему аудиту.
− НИИ ФМ им. Б. Атчабарова: получение информации и справок по научной деятельности лаборатории, обеспеченности кадрами, оснащенности оборудованием.
− Отдел магистратуры и докторантуры: Получение информации и справок об обучающихся по программе магистратуры и докторантуры осуществляющих научно-исследовательскую деятельность.
− Научная библиотека: Совместная организация и проведение семинаров по публикационной активности.
− Пресс-служба: Информационный анонс по проводимым и планируемым научным мероприятиям, конкурсам на финансирование научных исследований.