По результатам Национального рейтинга лучших вузов Казахстана -2019, проводимого Независимым агентством по обеспечению качества в образовании (НАОКО), КазНМУ занял 1-ое место в институциональной рейтинге в категории медицинских вузов.
В рейтинге вебсайтов казахстанских вузов, вебсайт КазНМУ занял 10-ое место среди 116 вузов РК.
По отдельным индикаторам Национального рейтинга, КазНМУ получил следующие номинации:
- Лидер по репутационной оценке экспертов;
- Лидер по репутационной оценке работодателей;
- Лидер по интернационализации.
Независимое агентство по обеспечению качества в образовании, https://iqaa-ranking.kz/